La Unidad Educativa Colegio San Juan Pablo II, Fue fundado el 01 de septiembre del 2006, funcionando con una sola sección por grado, con una matrícula desde maternal hasta el sexto grado con 150 niños y niñas y de los mismos 19 becados, siendo sus fundadores Miriam Guerrero de Garrido, Soraya Sira Navarro, Francisco José Vicente Garrido Guerrero, Celide Guerrero, Celide Domínguez, José Francisco Garrido Guerrero, Moraysa Tortolani, Argelia Ávila y Leonardo Chirinos, siendo la directora la Prof. Miriam Guerrero de Garrido.

Posteriormente la dirección del plantel para el año 2008 fue ocupada por la Profesora Soraya Silva, para el momento se contaba con una matrícula de 185 estudiantes entre los niveles de inicial, primaria y educción media, contando con una sección cada una desde I nivel hasta 1^er año de educción media.

Para el año 2010 la dirección es asumida por la Prof. Dalia Leal de Fiallo, la cual bajo su desempeño en la misma se incrementó la matrícula de la institución, comprendidas desde inicial, primaria y Educación Media de 1er año a 5^to año de Media General con dos secciones cada uno, encontrándose la misma en el registro de la institución tres promociones de bachilleres egresados en Mención Ciencias.

Luego en el año 2019 presentó problemas administrativos con los dueños, motivo por la cual zona educativa decide un cierre, finalmente, se pronuncia tomando en cuenta con la matricula flotante y es donde la jefa de zona Educativa Prof. Ana Rodríguez en conjunto la Prof. Lenyis Martínez jefa de distritos escolares, derogan la decisión de no cerrar la U.E Juan Pablo II. Para el mes de septiembre nombran a la Prof. Margarita Pineda como directora de la institución, evidenciándose que la matricula fue emigrando a otras instituciones, para lo cual se atendía una matrícula de 196 estudiantes,13 docentes y 4 obreros.  quien da continuidad al proceso educativo. Seguidamente para finales del año 2020 se conforma una A.C Civil sin fines de lucro, conformada por la siguiente directiva: Prof. Margarita Pineda, Prof. Irma Pineda, Prof. Johanna Fonseca, Lic. Orlando Rivero y Prof. Alexis Palencia, dicha Asociación Civil debidamente registrada encaminan las riendas del colegio, logrando nuevo epónimo aprobado por Z.E, llamándose C.E. SAN JUAN PABLO II, donde progresivamente aumento la matricula y por ende el personal, así mismo  mejoras de infraestructuras y dotación de mobiliarios.

 Actualmente cuenta con una estructura directiva y coordinadores de la siguiente manera: Prof. Margarita Pineda directora, Prof. Irma Pineda subdirectora academia, Prof. Sonia Pineda subdirectora Administrativo, Prof. Johanna Fonseca Coordinadora Control y Registro, Prof. Miriam Pineda coordinadora de evaluación, Prof. Zulimar Camacho acompañante pedagógico de media general, Prof. Vilmida Méndez Especialista en Humano Cristiano Inicial y Primaria, Prof. Liliana Pineda  Asesor Pedagógico de Inicial y Primaria y Prof. Ángel Pineda coordinador de personal, equipo de bienestar estudiantil Lic. Psicología Arnali Pérez, Lic. Lisettee Aguiar psicopedagoga y Lic. Liliana Medina psicopedagoga, se cuenta con una matrícula general de  739 estudiantes distribuida de la siguiente manera, Educación Inicial 29, Primaria 271, y Media general 439.